شملت الدراسة في البداية 600 رجل أسود - 399 مصابين بمرض الزهري، 201 منهم لم يكن يحمل المرض. أجريت الدراسة دون موافقة المرضى. أخبر الباحثون الرجالَ أنهم يعالجون من "دم سيئ"، وهو مصطلح محلي يستخدم لوصف العديد من الأمراض، بما في ذلك مرض الزهري، وفقر الدم، والتعب. حصل الرجال على فحوصات طبية مجانية وتأمين دفن مقابل مشاركتهم في الدراسة. على الرغم من توقعها في الأصل أن تستمر 6 أشهر، استمرت الدراسة لمدة 40 عاماً.

عام 1947، أعتمد البنسلين كعلاج للزّهري. كان أمام الأطبّاء المشاركين في دراسة توسكيجي آنذاك معالجة كل المشاركين المصابين بالزّهري قبل إيقاف الدراسة، أو علاج مجموعة منهم بالبنسلين كعينة. لكن الأطباء، عوضاً عن ذلك، تابعوا الدراسة دون معالجة أي مشارك، حاجبين المعلومات حول البينيسلين، والعلاج به، عن جميع المرضى. إضافةً إلى ذلك، منع العلماء المشاركين أهالي تلك المنطقة من مقاطعة ماكون، من الوصول لبرامج علاج الزّهري المتاحة. في وقت كانت الحكومة الأمريكية ترعى عدة برامج صحية لتشكيل "مراكز العلاج السريع" للقضاء على المرض باعتماد البنسلين. لم يلقَ الرجال حتفهم فحسب، بل ومعهم 40 زوجة و19 طفلاً ولدوا حاملين للزهري الخلقي. بحلول نهاية الدراسة عام 1972، لم يكن هناك سوى 74 مشارك منهم على قيد الحياة. أقام الرئيس الأميركي عام 1997 حفلًا في البيت الأبيض على شرف ضحايا الدراسة حضره 5 ناجين منها. قال كلينتون آنذاك:

"لا يمكن التراجع عما حدث، ولكن يمكننا أن نكسر حاجز الصمت، ويمكننا التوقف عن تجاهل المشكلة. ويمكنني أن أتحدث نيابة عن الشعب الأميركي وأقول أن ما نجم عن الحكومة الأمريكية أمر مخزٍ، وأعتذر لمواطنيننا الأمريكيين السود. حكومتنا الفدرالية دبرت دراسة بشكل عنصري واضح".

بين منتصف الأربعينيات ومنتصف السبعينيات، أجريت أكثر من 4000 تجربة إشعاعية على عشرات الآلاف من الأمريكيين، بعد أن قامت وكالة الدفاع الأميركية بتمويل دراسات أجراها الدكتور يوجين سينغر، بين عامي 1960 و1971. قام سينغر بتجارب إشعاعية كاملة في جامعة سينسيناتي على أكثر من 90 فقير وأسود في مراحلهم المتأخرة من سرطانات وأورام لا شفاء منها. وقام بتزوير استمارات الموافقة، ولم يُبلِّغهم بمخاطر الإشعاع. عمل سينغر على إعطاء المرضى أكثر من 100 راد (1 غراي) من الإشعاع على الجسم كله، ما تسبب لكثير منهم بالألم الشديد والقيء. توفي ربع عدد المشاركين تقريباً بسبب التسمم الاشعاعي. شكك النقاد بمبرراته الطبية وأكدوا أن غرضه الرئيس كان دراسة التأثيرات الحادة الناجمة عن التعرض للإشعاع، رغم تأكيده على غاياته الطبية في البحث عن علاج.